Zoonoses原创论文 一种基于FTA卡的粪便中大肠埃希菌快速检测方法

  大肠杆菌O157：H7（i O157：H7）可引起人类和动物的严重疾病，因此导致严重的公共卫生问题。因此，发展快速和可视化的检测的新方法来诊断E.coli O157：H7感染及监测其流行情况，对其预防和控制至关重要。该研究采用环介导等温扩增（LAMP）比色方法检验测试E.coli O157：H7，主要利用DNA提取试剂盒和FTA卡（Flinders Technology Associates card）提取核酸，并结合LAMP比色法。该方法能有效地将E.coli O157：H7与其他病原体区分开，在标化粪便样本中的检出限为25 CFU/mL。此外，利用FTA卡可实现样品核酸在室温下的提取和运输。仅使用简单的恒温设备，即可在35 min内完成整个检验测试过程。因此，基于FTA卡的核酸提取LAMP比色法能快速、灵敏、特异地检测E.coli O157：H7，并且有望大范围的应用于控制E.coli O157：H7感染，尤其是在资源有限的环境中。

  该研究成功建立了一种基于FTA卡的LAMP比色检测的新方法，用于i O157：H7的简便、快速检测，拥有非常良好的灵敏度和特异性。该方法有几个优点，首先，能够在不使用复杂设备的情况下进行核酸提取和运输，以及能够直观地读取结果。且该方法在35 min内获得了较高的灵敏度(LOD=25 CFU/mL)和良好的特异性，而常规的PCR法则需要1.5 h。此外，基于FTA卡的LAMP比色检测结果与PCR法的检测结果拥有非常良好的一致性。通过设计特定的引物，该方法还可用于粪便中其他病原体的检测。在未来，这项研究有望与E.coli O157：H7检验测试方面的最新进展保持一致，包括数字化、集成和便携式分析系统。该方法有望成为临床检测和监测人畜共患感染的一种有价值的诊断工具，也为现场检测提供了巨大的潜力，特别是在资源有限的情况下。

  图2. 基于FTA卡的LAMP比色检测法的灵敏度和特异性。A. 检测不同浓度的i O157：H7的灵敏度。B. E. coli O157：H7的特异性。注释：“****” 为p 0.0001；NTC为无模板对照。所有的实验都重复了三次。

  上海交通大学医学院-国家热带病研究中心全球健康学院2023届硕士毕业研究生陈福民和硕士研究生王君煜为共同第一作者，全球健康学院殷堃研究员、上海交通大学医学院瑞金医院北院区消化科陈平主任为该论文的共同通讯作者。本研究得到上海市农业应用技术发展计划中国(X2020-02-0800-12-F01110)、国家自然科学基金项目（22104090）、上海市自然科学基金项目（22ZR1436200）和转化医学国家重大科学技术基础设施（上海）（TMSK-2021-114）的支持。

  课题组长殷堃博士，研究员、上海市高层次人才，担任环境健康与生态安全系系主任、学术带头人，分子诊断与耐药防控课题组负责人。目前在Chemical Society Reviews、Advanced Sciences、Analytical Chemistry、Lab on a chip等顶级期刊发表第一和通讯作者论文、IEEE会议论文50余篇，他引2400余次，出版学术专著2部，获授权中国发明专利8项。课题组与哈佛大学、宾夕法尼亚大学、伦敦大学学院、加州尔湾分校、康涅狄格大学等高校及仁济、瑞金、新华医院有着紧密的合作，具有广阔的职业发展空间。

  课题组长期招聘博士后，科研助理。应聘者请将个人详细简历（包括代表论文和成果奖励等）及申请信（简明概述科研兴趣、专业特长、实验技能等发至。请在邮件主题中注明应聘者姓名+应聘职位

  Zoonoses 是全球第一本有关共患病的金色开源期刊，旨在搭建共患病领域科研人员、临床医生、兽医和公共卫生学者间沟通的桥梁。Zoonoses致力于刊载有关病毒性、细菌性、寄生虫性、真菌性共患病的流行病学、病原学、生物学、诊断、预防、治疗和管理等方面的最新研究。

  Zoonoses由中国疾病预防控制中心病毒学首席科学家董小平教授和美国德克萨斯大学医学分部Lynn Soong教授担任共同主编。